Gerade eben habe ich in FileZilla entdeckt, dass eine Suchfunktion eingebaut ist, mit der man Dateien auf einem FTP Server suchen kann.
Diese Suchfunktion kann man aufrufen, in dem man F3 drückt. Dabei kann recht detailliert nach einer Datei gesucht werden. Sogar Reguläre Ausdrücke (RegEx) können dabei verwendet werden.

